Die Gemeinde El Rosario liegt in der südlichen Pazifikregion. Die durchschnittliche jährliche Niederschlagsmenge liegt zwischen 1,200 und 1,400 mm.
Die Topographie des Gebiets ist rau und weist ein Gefälle von 15 % auf. Es gibt Bäche, die die Gemeinde durchqueren und in den Cocibolca-See münden, der eine Höhe von 470 m über dem Meeresspiegel hat
Im Agrarsystem sind die repräsentativen Güter Kaffee, Zuckerrohr, Grundgetreide, Mais, Bohnen, Zucker, Gemüse und Obstbäume. Das Agroforstsystem wird durch einen Produktionswald und mehrjährige Nutzpflanzen wie Kaffee repräsentiert.
Die Vegetation der Gemeinde besteht aus Gehölzen wie Lorbeer, Erdbeerbaum, Quebracho, Jiñocuao, Malinche, Guanacaste, Guapinol, Königszeder, Helenque, Tempate, Chilamate, Chiquirín, Tigüilote, Sacuanjoche und einer Vielzahl von Zier- und Heilpflanzen.
In der Gemeinde gibt es eine Abfallbehandlungsanlage, die als Modell für die Behandlung und Bewirtschaftung von Müll gilt, hier sind Versuchsräume zur Herstellung von Kompost und Humusdünger, Gärten und Baumschulen für Zier-, Nutz- und Obstpflanzen zu sehen.
Auf dieser Website gibt es einen Informationsraum, in dem unter anderem der Prozess der Müllauswahl und -entsorgung sowie seine Wiederverwendung zur Herstellung von Düngemitteln erklärt wird. Die Anlage liegt 1.5 Kilometer vom Stadtgebiet der Gemeinde entfernt, in der Gemeinde Bertha Díaz.
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