El municipio de Morrito se localiza al sureste del país, es el municipio más pequeño del departamento de Río San Juan.
Río Tepenaguazapa
Entre los principales ríos se encuentran el río Tepenaguazapa, el río Oyate y el río Quiwaye, los que poseen los mayores caudales y extensión en el municipio; siendo la subcuenca del Tepenaguazapa las más grande, con unos 384 kms2. Además de otras quebradas menores como El Estero, Los Coralillos, Mayasang, El Garrobal, Candelaria, Paso Hondo, Los Charrales, La Chepa, El Jobo, Cobano y Garrobito, y las lagunas como Las Marillitas y Chagüitillo.
El Río Tepenaguazapa es fronterizo con San Miguelito, lo que permite que los pobladores de ambos pueblos se encuentren en el río y compartan momentos agradables. El río posee aproximadamente 25 metros de ancho, en donde se observan monos congos y diversidad de aves.
Otro recurso hídrico del municipio es el río Kiway, es fronterizo con el municipio de El Almendro, el sendero que baja hacia el río es de dificultad media y mientras bajás aprecias el bosque y la fauna del sitio. A la orilla se puede realizar senderismo y si se coordina con los pobladores podés montar a caballo.
Las islas San Bernardo y Bernardito son un espacio natural y conservado donde conocerás un faro antiguo de la zona, disfrutarás de un baño en sus playas y observarás aves nativas y migratorias.
Río Kiway
El cerro San Marcos cuenta con un mirador natural en su cima, una cruz de concreto y un árbol de limón que se muestra solitario, pero lleno de vida. Ascender a la cumbre lleva aproximadamente una hora sobre un camino de dificultad media y desde lo alto se aprecia el cerro La Gateada, Acoyapa, San Miguelito y Morrito.
El balneario El Retumbo es uno de los sitios más visitados por los pobladores en época de Semana Santa, en esta temporada ofrecen servicios de alimentación y venta de bebidas. Ideal para darse un baño o descansar bajo la sombra de los árboles.
La barca flotante, es una barca ubicada en las aguas del Lago Cocibolca, que sirve para realizar actividades temáticas, brinda servicio de alimentación y bebidas, desde la barca se aprecia la inmensidad del lago, y se puede tomar el sol o darse un relajante baño.
Cerro San Marcos
La finca agroturística Armonía tiene dos lagunas artificiales, una de ellas dedicada a la crianza de tilapias, aquí el visitante puede escoger su pez y allí mismo se lo preparan. También se organizan recorridos a caballos, exhibiciones de ordeño, cuido y mantenimiento de cerdos, y actividades de reforestación. La finca también ofrece servicio de alojamiento y alimentación con previa coordinación. Se encuentra ubicada en el empalme del municipio.
La finca El Almirante es una finca de 300 manzanas de extensión, posee árboles frutales, cítricos y ganado, aquí podés realizar recorridos a pie o a caballo, participar en la elaboración de tortillas, cuajadas y hasta en el ordeño para degustar un riquísimo pinol con leche. Se ubica sobre la carretera a Morrito.
La finca Guantánamo tiene una excelente vista del lago y un espacio adecuado para el baño, es muy visitada por los lugareños sobre todo en Semana Santa. Se ubica a 6.9 kms. del muelle de Morrito.
El municipio tiene un clima tropical, con temperatura que varían entre los 22 °C y 30 °C, la precipitación promedio anual varía entre los 1.800 y 2.500 mm. El principal ecosistema es el bosque de galería, ubicado originalmente en las riberas de los ríos.
Algunas especies del bosque nativo de la zona son cedro real, espavel, laurel, ceiba, coyol, madero negro, guácimo, jobo, madroño y guanacaste.
La fauna representativa del municipio son las loras, lapas, cotorras, gavilán, zopilote, quenquen, garza, garzones, gorriones, codornices, zenzontle, guardabarranco, zanates, pato aguja y pato real. Entre los peces se pueden encontrar el gaspar, róbalo, roncador, mojarra, guapote, lagunero, pez sierra, sábalo real, machaca, sarna y tilapia. En los reptiles se destacan la tortuga, terciopelo, coral, cascabel, lagarto cuajipal, garrobos, iguanas negras y verdes.
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